【出发点】

脑脊液(CSF)的宏基因组测序(NGS)具有在单次测试中鉴定多种病原体的潜力。

【方法】

在一项为期1年的多中心前瞻性研究中,作者团队研究了CSF的宏基因组测序在住院患者中诊断传染性脑膜炎和脑炎的有效性。通过正交实验室测试证实了对宏基因组测序后病原体的所有阳性测试。通过与临床微生物测序委员会的电话会议和调查引发医师反馈。通过回顾性图表评估评估临床效果。

【结果】

作者团队在8家医院招募了204名儿科和成人患者。患者病情严重:48.5%的患者入住重症监护室,所有研究患者中30天死亡率为11.3%。 57名患者(27.9%)共诊断出58种神经系统感染。在这58种感染中,宏基因组测序结果发现13种(22%)未在源医院通过临床试验确定。在剩余的45种感染(78%)中,19种在传统检测和宏基因组测序结果中同时进行了诊断。在未通过宏基因组鉴定的26种感染中,11种仅通过血清学检测确诊,7种通过CSF以外的组织样本诊断,8种由于CSF中的病原体滴度低为阴性。仅由宏基因组测序结果诊断13种中,8个可能具有临床效果,13种中7个用于指导治疗。

【结论】

常规微生物检测通常不足以检测所有神经侵袭性病原体。在这项研究中,从脑膜炎或脑炎患者获得的脑脊液的宏基因组测序改善了神经系统感染的诊断,并在某些情况下提供了可操作的信息。

参考文献

Wilson MR,Sample HA,Chiu CY,et al.Clinical Metagenomic Sequencing for Diagnosis of Meningitis and Encephalitis.N Engl J Med,2019.

 

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